Изменения

Прямой анализ экспрессии генов {{---}} трудная и дорогостоящая задача, поэтому часто обращаются к транскриптомным данным. Транскриптомные данные чаще всего получают с помощью РНК-секвенирования (RNA-seq) или ДНК-микрочипов (DNA-microarray). С помощью специальных процедур из взятой у пациента пробы выделяют мРНК, которая затем наносится на ДНК-микрочип, где цепочки мРНК зацепляются, образуя двухцепочечные молекулы. Число цепочек мРНК, зацепившихся за определенный участок ДНК-микрочипа, определяет интенсивность свечения этого участка при сканировании. Так косвенно определяют экспрессию каждого из генов. Следующая проблема, с которой сталкиваются исследователи {{---}} слишком большое количество генов (например, у человека их около 28000). Вследствие этого очень тяжело обучать модели, поэтому приходится прибегать к [[Уменьшение размерности|уменьшению размерности]].

[[Файл:Melif scheme.png|400px|thumb|Описание алгоритма MeLiF]]

Для уменьшения размерности в случае биологических данных применяются методы, основным критерием которых становится их скорость. Поскольку количество генов очень велико, чаще всего нет возможности опробовать встраиваемые и оберточные методы. Чаще всего, используют фильтры.