462
правки
Изменения
→Определение фазы клеточного цикла
Классификация клеток является базовой задачей микроскопии. Существует множество признаков, по которым можно поделить клетки, но для части из них уже существуют готовые архитектуры сверточных сетей.
=== Определение фазы клеточного цикла ===
Одним из признаков, по которым можно разделить клетки, является определение фазы клеточного цикла, в которой находится клетка. Эта задача имеет практическое применение для обнаружения поврежденных клеток, которые при визуализации будут кластеризоваться отдельно от остальных. Так как клетки проходят стадии клеточного цикла непрерывно, то удобно их классифицировать, используя флуоресцентные метки. Для этого клетку окрашивают флуоресцентным красителем и используют флуоресцентный микроскоп, который фиксирует расположение и степень свечения. Сверточная сеть обучается на изображениях с этими метками и дает на выходе не только классификацию каждой клетки, а также визуализирует процесс клеточного цикла. Классификация и визуализация являются всего лишь различными способами интерпретации результатов, поэтому строятся на основе одних и тех же выведенных закономерностяхзакономерностей<ref>[https://www.nature.com/articles/s41467-017-00623-3#supplementary-information Philipp Eulenberg — Reconstructing cell cycle and disease progression using deep learning, 2017]</ref>.
[[Файл:Cell cycle classification.png|center|700px|thumb|Архитектура сверточной нейронной сети для определения фазы клетки из [https://www.nature.com/articles/s41467-017-00623-3#supplementary-information/ статьи.]]]
Особенностью работы данной сверточной сети является необходимость разметить только небольшую часть данных, на основании чего она далее учится размечать самостоятельно.
