462
правки
Изменения
→Склеивание изображений
Не всегда изучаемый объект полностью помещается на один снимок микроскопа. В связи с этим стоит задача склеивания изображений для дальнейшего исследования целых клеточных культур, используя различные методы визуализации. Эту задачу может решить инструмент для сшивания изображений микроскопии (англ. Microscopy Image Stitching Tool, MIST)<ref>[https://ieeexplore.ieee.org/document/7359951 Joe Chalfoun {{---}} MIST: Microscopy Image Stitching Tool, 2015]</ref>. Программа предназначена для быстрого и точного склеивания больших двумерных сеток перекрывающихся изображений покадровых снимков микроскопа. В основе работы MIST лежит оценка параметров модели на основе вычисленных попарных перемещений, а затем минимизация ошибок склеивания путем оптимизации перемещений в пределах квадратной области.
[[Файл:MIST.jpg|left|450px|thumb|Рисунок 8. Примеры изображений, склеенных с помощью MIST<ref>[https://www.nature.com/articles/s41598-017-04567-y Joe Chalfoun {{---}} MIST: Accurate and Scalable Microscopy Image Stitching Tool with Stage Modeling and Error Minimization, 2017]</ref>.]]
Алгоритм MIST состоит из четырех шагов<ref name="mist"/>. Сначала вычисляются всевозможные перемещения между соседними покадровыми изображениями. После чего, если параметры модели не указаны пользователем, оценивается модель механического предметного столика на основе вычисленных перемещений. Затем оптимизируются перемещения между изображениями для уменьшения ошибок склеивания и составляется полученное изображение (рисунок 8).
Необходимо помнить, что MIST был разработан для склеивания микроскопических изображений, полученных с помощью механического предметного столика, который перемещает образец по повторяющейся сетке, так что это накладывает ограничение на его использование.
