Изменения

Перейти к: навигация, поиск

Компьютерное зрение в микроскопии

115 байт убрано, 17:52, 14 января 2021
Классификация клеток
== Классификация клеток ==
[[Файл:Dividing Cell Fluorescence-ru.jpg|left|300px|thumb|Пример клетки с различными флуоресцентными маркерами. [https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30865716/ статьи.]]]
Классификация клеток является базовой задачей микроскопии. Обычно для этого используются изображения, полученные на флуоресцентных микроскопах, так как классификаторы для изображений с обычных оптических микроскопов не способны отразить биологическое разнообразие различных типов клеток. Клетки можно делить по фазе в клеточном цикле, типу (повержденные или нет, раковые или нормальные), физиологическому состоянию, виду и другим признакам. Для большинства задач классификации уже существуют готовые архитектуры сверточных сетей, использующие флуоресцентные метки в качестве категориальных.  
=== Определение фазы клеточного цикла ===
Одним из признаков, по которым можно разделить клетки, является определение фазы клеточного цикла, в которой находится клетка. Эта задача имеет практическое применение для обнаружения поврежденных клеток, которые при визуализации будут кластеризоваться отдельно от остальных. Сверточная сеть обучается на изображениях с флуоресцентными метками, о которых было сказано ранее, и дает на выходе не только классификацию каждой клетки, а также визуализирует процесс клеточного цикла, используя нелинейное уменьшение размерности. Классификация и визуализация являются всего лишь различными способами интерпретации результатов, поэтому строятся на основе одних и тех же выведенных закономерностей.
462
правки

Навигация