Изменения

Перейти к: навигация, поиск

Компьютерное зрение в микроскопии

562 байта добавлено, 17:48, 4 января 2021
Нет описания правки
Компьютерное зрение помогает автоматизировать обработку изображений, полученных с помощью микроскопии. С появлением сверточных нейронных сетей стало возможным эффективно и с хорошей точностью классифицировать клетки, отслеживать внутриклеточные и межклеточные процессы, сегментировать полученные изображения, улучшать их качество и решать другие задачи без непосредственного участия человека.
 
= Задачи компьютерного зрения в микроскопии =
== Классификация клеток ==
[[Файл:Cell cycle classification.png|center|900px|thumb|Архитектура сверточной нейронной сети для определения фазы клетки из [https://www.nature.com/articles/s41467-017-00623-3#supplementary-information/ статьи.]]]
Особенностью работы данной сверточной нейросети является необходимость разметить только небольшую часть данных, на основании чего она далее учится размечать самостоятельно.
 
=== Идентификация раковых клеток ===
Для классификации раковых клеток используется сверточная нейронная сеть с архитектурой VGG-16, а также трансферное обучение, то есть модель предварительно обучается на другом огромном объеме данных.
[[Файл:microscopy_cnn.png|center|700px|thumb|Архитектура сверточной нейронной сети для классификации раковых клеток из [https://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0213626/ статьи.]]]
Такая сверточная сеть лучше справляется с задачей классификации клеток по сравнению с экспертом-человеком, особенно на изображениях с недостаточно хорошим качеством.
== Сегментация изображений ==
Задача клеточной сегментации состоит в том, чтобы аннотировать изображения, то есть отмечать границы клеток. Для этой задачи используется сеть U-Net.
[[Файл:U-net-architecture.png|center|700px|thumb|Архитектура сверточной нейронной сети для сегментации клеток из [https://lmb.informatik.uni-freiburg.de/people/ronneber/u-net/ статьи.]]]
== Отслеживание объектов и процессов ==
== Сегментация изображений ==
== Улучшение качества ==
 
== Подсчет клеток ==
 
==
= См. также =
462
правки

Навигация