Алгоритм Ландау-Вишкина (k несовпадений) — различия между версиями
Margarita (обсуждение | вклад) (→Алгоритм) |
Margarita (обсуждение | вклад) (→Алгоритм) |
||
| Строка 28: | Строка 28: | ||
|} | |} | ||
| − | [[Файл:algLandauVishkin2.png|thumb|380px|right| | + | [[Файл:algLandauVishkin2.png|thumb|380px|right| Подстроки, которые сравниваются в процедуре extend]] |
| − | Рассмотрим процедуру <tex>extend</tex> подробнее. Она сравнивает подстроки <tex>y[j + 1...i + m]</tex> и <tex>x[j - i + 1...m]</tex>, в случае несовпадения <tex>b</tex> увеличивается и таблица текстовых несовпадений обновляется. Это происходит пока либо не будет найдено <tex>k + 1</tex> несовпадений, либо не будет достигнуто <tex>y[i+m]</tex> с не больше чем <tex>k</tex> несовпадениями, то есть найдено вхождение образца, начинающееся с <tex>y[i+1]</tex>. | + | Рассмотрим процедуру <tex>extend</tex> подробнее. Она сравнивает подстроки <tex>y[j + 1...i + m]</tex> и <tex>x[j - i + 1...m]</tex>, в случае несовпадения <tex>b</tex> увеличивается и таблица текстовых несовпадений обновляется. Это происходит пока либо не будет найдено <tex>k + 1</tex> несовпадений (учитывая несовпадения, которые были найдены раньше на <tex>i</tex>-ой итерации), либо не будет достигнуто <tex>y[i+m]</tex> с не больше чем <tex>k</tex> несовпадениями, то есть найдено вхождение образца, начинающееся с <tex>y[i+1]</tex>. |
==Пример== | ==Пример== | ||
Версия 16:03, 15 июня 2014
Постановка задачи
Дано число текст и образец , . Требуется найти все подстроки текста длины , с не более чем несовпадающими символами.
Алгоритм
При анализе текста используется двумерный массив , содержащий информацию о несовпадениях текста с образцом. По завершении анализа в его -й строке содержатся позиции в первых несовпадений между строками и . Таким образом, если , то , и это -е несовпадение между и , считая слева направо. Если число несовпадений с подстрокой меньше , то, начиная с , элементы -й строки равны значению по умолчанию .
Заметим, если , то подстрока отличается от образца не более, чем на символов, и, таким образом, является решением задачи.
Затем образец сканируется параллельно с текстом слева на права по одному символу за раз. На итерации с образцом сравнивается подстрока . - обозначим самую правую позицию в тексте, достигнутую за предыдущие итерации, то есть является максимальным из чисел , где . Если , в присваивается результат работы , которая находит количество несовпадений между и . Если не превышает , вызывается процедура , которая сравнивает подстроки и . Переменная будет рассмотренна ниже.
|
tm[0...n-m][1...k+1] = m+1 // инициализация
r = 0
j = 0
for i = 0 to n - m
b = 0
if i < j
b = merge(i, r, j)
if b < k + 1
r = i
extend(i, j, b)
|
Рассмотрим процедуру подробнее. Она сравнивает подстроки и , в случае несовпадения увеличивается и таблица текстовых несовпадений обновляется. Это происходит пока либо не будет найдено несовпадений (учитывая несовпадения, которые были найдены раньше на -ой итерации), либо не будет достигнуто с не больше чем несовпадениями, то есть найдено вхождение образца, начинающееся с .
Пример
Пусть , , .
| tm | 1 | 2 | 3 | x[1..m] | y[i+1..i+m] |
| 0 | 2 | 3 | 4 | tram | thet |
| 1 | 1 | 2 | 3 | tram | hetr |
| 2 | 1 | 2 | 3 | tram | etri |
| 3 | 3 | 4 | 5 | tram | trip |
| 4 | 1 | 2 | 3 | tram | ripp |
| 5 | 1 | 2 | 3 | tram | ippe |
| 6 | 1 | 2 | 3 | tram | pped |
| 7 | 1 | 2 | 3 | tram | pedt |
| 8 | 1 | 2 | 3 | tram | edtr |
| 9 | 1 | 2 | 3 | tram | dtra |
| 10 | 4 | 5 | 5 | tram | trap |
| tm | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | x[1..m-i] | x[i+1..m] |
| 1 | 1 | 2 | 3 | 5 | 5 | tra | ram |
| 2 | 1 | 2 | 5 | 5 | 5 | tr | am |
| 3 | 1 | 5 | 5 | 5 | 5 | t | m |