Многопоточность в машинном обучении
Следует выделить следующие виды параллелизма:
- Параллелизм на уровне инструкций (ILP): несколько инструкций исполняются одновременно.
- Параллелизм типа одна инструкция множество данных (SIMD): одна операция применяется к множеству данных
- Многопоточный параллелизм: несколько независимых рабочих потоков взаимодействуют через абстракцию совместно используемой памяти.
- Распределенные вычисления: несколько независимых рабочих компьютеров взаимодействуют по сети. (MLlib на Spark, Mahout на Hadoop)
Идеи используемые для ускорения вычислений в ML
Параллелизм для ускорения линейной алгебры.
Многие операции линейной алгебры, например, векторное сложение, произведение матриц и вычисление нормы состоят из большого количества независимых операций. Поэтому можно сильно повысить их производительность как за счёт ILP и SIMD параллелизма для маленьких данных, так и за счёт многопоточности для больших данных. От ускорения линейной алгебры особенно выигрывают нейронные сети, так как большую часть времени их работы занимает умножение матриц.
Примеры оптимизаций:
- Высоко оптимизированные тензорные библиотеки для арифметики.
- Алгоритмы в терминах матричных операций, а не векторных операций, насколько это возможно.
- Broadcast операции вместо циклов.
- Распараллеленные реализации некоторых специальных операций (таких как свертки для CNN).
Параллелизм broadcast операций
Просмотрите код наивной реализации поэлементное произведение двух векторов на Python
def elementwise_product(x, y): assert(len(x) == len(y)) z = numpy.zeros(len(x)) for i in range(len(x)): z[i] = x[i] * y[i] return z
Такой код лучше заменять на broadcast операции из numpy, которые выигрывают от векторизации и ILP. Также такой код может быть легко распараллелен для больших векторов
Параллелизм в оптимизации гиперпараметров
Для параллельной оптимизации гиперпараметров можно использовать поиск по решётке или случайный поиск в которых мы можем оценить параметры независимо. Такая оптимизации часто встречаются в библиотеках машинного обучения.
Параллелизм кросс-валидации
Полная кросс-валидация, k-fold, t×k-fold, Leave-One-Out легко распараллеливаются на несколько потоков, каждый из которых работает на своем разбиении данных
Параллелизм GPU
Графические процессоры позволяют применять одну и ту же операцию параллельно к десяткам тысяч элементов за счет большого числа потоков.
Фреймворки машинного обучения, такие как TensorFlow, PyTorch и MxNet используют эти возможности через библиотеки от компаний производителей графических ускорителей и открытые фреймворки:
- CUDA - язык параллельного программирования/вычислительная платформа для вычислений общего назначения на графическом процессоре
- cuBLAS - библиотека представляет собой реализацию BLAS (базовых подпрограмм линейной алгебры) поверх среды выполнения CUDA.
- OpenCL - фреймворк для написания компьютерных программ, связанных с параллельными вычислениями на различных графических и центральных процессорах, а также FPGA
Пример перемножения матриц на cuBLAS
void gpu_blas_mmul(cublasHandle_t &handle, const float *A, const float *B, float *C, const int m, const int k, const int n) { int lda = m, ldb = k, ldc = m; const float alf = 1; const float bet = 0; const float *alpha = &alf; const float *beta = &bet; // Do the actual multiplication cublasSgemm(handle, CUBLAS_OP_N, CUBLAS_OP_N, m, n, k, alpha, A, lda, B, ldb, beta, C, ldc); }
Пример перемножения матриц на PyCUDA
import pycuda.gpuarray as gpuarray import numpy as np import skcuda.linalg as linalg # --- Initializations import pycuda.autoinit linalg.init() A = np.array(([1, 2, 3], [4, 5, 6])).astype(np.float64) B = np.array(([7, 8, 1, 5], [9, 10, 0, 9], [11, 12, 5, 5])).astype(np.float64) A_gpu = gpuarray.to_gpu(A) B_gpu = gpuarray.to_gpu(B) C_gpu = linalg.dot(A_gpu, B_gpu) print(np.dot(A, B)) print(C_gpu)
Наивная реализация перемножения матриц на OpenCL
// First naive implementation __kernel void myGEMM1(const int M, const int N, const int K, const __global float *A, const __global float *B, __global float *C) { // Thread identifiers const int globalRow = get_global_id(0); // Row ID of C (0..M) const int globalCol = get_global_id(1); // Col ID of C (0..N) // Compute a single element (loop over K) float acc = 0.0f; for (int k = 0; k < K; k++) { acc += A[k * M + globalRow] * B[globalCol * K + k]; } // Store the result C[globalCol * M + globalRow] = acc; }
Параллелизм в стохастическом градиентном спуске
Можно запустить внешний цикл стохастического градиентного спуска (SGD) параллельно в пуле потоков и использовать конструкции синхронизации, такие как блокировки, чтобы предотвратить состояние гонки. Однако из-за накладных расходов на синхронизацию ускорение может получиться маленьким.
Еще более интересная идея называется асинхронным SGD или Hogwild. SGD запускается параллельно в несколько потоков без какой-либо синхронизации. Теперь состояния гонки могут возникнуть, но во многих случаях это хорошо, потому что они просто немного изменяют шум и ошибки уже присутствующие из-за случайного выбора градиента.
Параллелизм в методе k ближайших соседей
Основное время работы метода k ближайших соседей составляет поиск ближайших соседей. Так как расстояния до разных объектов независимы, то можно разбить объекты на группы, параллельно решить задачу во всех группах, а потом объединить результат[1]. Альтернативный подход - параллельная сортировка всех объектов, например, с использованием битонной сортировки[2].
Параллелизм в методе опорных веторов
Вычислительная сложность метода опорных векторов заключается в минимизации квадратичной функции. Первый вариант распараллеливания задачи - добавление параллелизма в алгоритм в явном виде, например, оптимизация большего количества переменных в SMO[3]. Второй подход - запись алгоритма через матричные операции, которые легко параллелизируемы[4].
Источники информации
- Principles of Large-Scale Machine Learning
- cuBLAS library user guide
- Matrix multiplication on GPU using CUDA with CUBLAS
- A short notice on performing matrix multiplications in PyCUDA
- CUDA C++ Programming Guide
- OpenCL SGEMM tuning for Kepler
- ↑ Implementation of a Parallel K-Nearest Neighbor Algorithm Using MPI
- ↑ Parallel Search of k-Nearest Neighbors with Synchronous Operations
- ↑ https://publikationen.uni-tuebingen.de/xmlui/bitstream/handle/10900/49015/pdf/tech_21.pdf Parallel Support Vector Machines
- ↑ https://www.researchgate.net/publication/6265163_Multiplicative_Updates_for_Nonnegative_Quadratic_Programming Multiplicative Updates for Nonnegative Quadratic Programming