Изменения

Прямой анализ экспрессии генов {{---}} трудная и дорогостоящая задача, поэтому часто обращаются к транскриптомным данным. Транскриптом {{---}} совокупность всех молекул РНК<ref>[https://ru.wikipedia.org/wiki/%D0%A0%D0%B8%D0%B1%D0%BE%D0%BD%D1%83%D0%BA%D0%BB%D0%B5%D0%B8%D0%BD%D0%BE%D0%B2%D0%B0%D1%8F_%D0%BA%D0%B8%D1%81%D0%BB%D0%BE%D1%82%D0%B0 Википедия: РНК]</ref>, которые присутствовали в клетке после завершения процесса трансрипции (получение РНК с матрицы ДНК). Транскриптом включает в себя матричную РНК (РНК, с которой впоследствии транслируются белки) и некодирующую РНК, которая, в свою очередь, не используется для получения белков. Транскриптомные данные чаще всего получают с помощью РНК-секвенирования (англ. RNA-seq) или ДНК-микрочипов (англ. DNA-microarray). С помощью специальных процедур из взятой у пациента пробы выделяют матричную РНК (мРНК), которая затем наносится на ДНК-микрочип, где цепочки мРНК зацепляются, образуя двухцепочечные молекулы. Число цепочек мРНК, зацепившихся за определенный участок ДНК-микрочипа, определяет интенсивность свечения этого участка при сканировании. Так косвенно определяют экспрессию каждого из генов. Следующая проблема, с которой сталкиваются исследователи {{---}} слишком большое количество генов (например, у человека их около 28000). Вследствие этого очень тяжело обучать модели, поэтому приходится прибегать к [[Уменьшение размерности|уменьшению размерности]].