462
правки
Изменения
→Определение фазы клеточного цикла
=== Определение фазы клеточного цикла ===
Одним из признаков, по которым можно разделить клетки, является определение фазы клеточного цикла, в которой находится клетка. Эта задача имеет практическое применение для обнаружения поврежденных клеток, которые при визуализации будут кластеризоваться отдельно от остальных. Сверточная сеть обучается на изображениях с флуоресцентными метками, о которых было сказано ранее, и дает на выходе не только классификацию каждой клетки, а также визуализирует процесс клеточного цикла, используя нелинейное уменьшение размерности. Классификация и визуализация являются всего лишь различными способами интерпретации результатов, поэтому строятся на основе одних и тех же выведенных закономерностей.
[[Файл:Cell cycle classification.png|right|700px|thumb|Архитектура сверточной нейронной сети для определения фазы клетки из <ref>[https://www.nature.com/articles/s41467-017-00623-3#supplementary-informationPhilipp Eulenberg — Reconstructing cell cycle and disease progression using deep learning, 2017]</ статьиref>.]]]Особенностью работы данной сверточной сети является необходимость разметить только небольшую часть данных, на основании чего она далее учится размечать самостоятельно. Интересно, что при визуализации фазы становятся упорядочены в хронологически правильном порядке, несмотря на то, что информация о порядке фаз не передавалась в сеть напрямую. Это говорит об эффективности использования флуорисцентных меток в качестве категориальных<ref>[https://www.nature.com/articles/s41467-017-00623-3#supplementary-information Philipp Eulenberg — Reconstructing cell cycle and disease progression using deep learning, 2017]</ref>.
=== Идентификация раковых клеток ===
[[Файл:microscopy_cnn.png|right|400px|thumb|Архитектура сверточной нейронной сети для классификации раковых клеток из [https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30865716/ статьи.]]]
