Алгоритм поиска подстроки в строке с помощью суффиксного массива
Пусть у нас есть образец , строка и суффиксный массив . Мы хотим найти все вхождения данного образца в данную строку.
Решение при помощи бинарного поиска
Понятно, что если образец входит в строку , то он является префиксом какого-нибудь ее суффикса. Если вхождений несколько, то в суффиксном массиве они будут находиться рядом друг с другом. Получается, что задача сводится к бинарному поиску в упорядоченном массиве.
Определим границы, в которых лежат вхождения. На первом шаге сравниваем суффикс и образец . Если суффикс лексикографически больше, то необходимо идти в левую половину , иначе в правую. На следующем шаге аналогично проверяем суффикс по середине от половины суффискного массива, затем от четверти и так далее. В результате проделанной работы получим левую и правую границы и соответственно. В этих границах и лежат вхождения образца в строку .
Время лексикографического сравнения образца с суффиксом равно длине их общего префикса и не может превышать . Поэтому время работы алгоритма равно .
Улучшение бинарного поиска
При двоичном поиске обозначим левую и правую границы текущего интервала как и соответственно. Изначально , . На каждой итерации будем сравнивать образец с суффиксом . Обозначим за длину общего префикса и , а за длину общего префикса и . Также обозначим за минимум из и . Значение будем поддерживать на каждой итерации двоичного поиска. Теперь, зная , можно начинать сравнение образца с суффиксом , начиная с символа. Это возможно, так как для любого суффикса из нашей границы от до первые символов совпадают. Если бы это было не так, то в суффиксном массиве в границе от до были бы суффиксы, которые сначала имеют совпадений, затем не имеют, а затем снова имеют, что говорит о неправильном построении суффиксного массива.
При таком поиске время работы равно .