Алгоритм Ахо-Корасик — различия между версиями

Материал из Викиконспекты
Перейти к: навигация, поиск
(Убирана пометка "в разработке")
м (Шаг 3: Дополнение)
Строка 28: Строка 28:
 
     \emptyset\text{, if $\pi(u)$ is root;}\\
 
     \emptyset\text{, if $\pi(u)$ is root;}\\
 
     up(\pi(u))\text{, else.}
 
     up(\pi(u))\text{, else.}
   \end{cases}</tex> - сжатая суффиксная ссылка, т.е. ближайшее допускающее состояние (терминал) перехода по суффиксным ссылкам.
+
   \end{cases}</tex> - сжатая суффиксная ссылка, т.е. ближайшее допускающее состояние (терминал) перехода по суффиксным ссылкам.<br /><br />
 +
Сжатые суффиксные ссылки могут отыскиваться при помощи ленивой рекурсии.
  
 
== Использование автомата ==
 
== Использование автомата ==
 
По очереди просматриваем символы текста. Для очередного символа <tex>c</tex> переходим из текущего состояния <tex>u</tex> в состояние, которое вернёт функция <tex>\delta(u, c)</tex>. Оказавшись в новом состоянии, отмечаем по сжатым суффиксным ссылкам образцы, которые нам встретились и их позицию (если требуется). Если новое состояние является терминалом, то соответствующие ему образцы тоже отмечаем.<br />
 
По очереди просматриваем символы текста. Для очередного символа <tex>c</tex> переходим из текущего состояния <tex>u</tex> в состояние, которое вернёт функция <tex>\delta(u, c)</tex>. Оказавшись в новом состоянии, отмечаем по сжатым суффиксным ссылкам образцы, которые нам встретились и их позицию (если требуется). Если новое состояние является терминалом, то соответствующие ему образцы тоже отмечаем.<br />
 
''Примечание.'' Если требуется найти только первое вхождение образца в текст, то существенно ускорить работу алгоритма могут пометки о посещённости узла, т.е. если узел посещён, то не переходить по сжатым суффиксным ссылкам. Вместо хранения пометок можно просто сбрасывать сжатую суффиксную ссылку.
 
''Примечание.'' Если требуется найти только первое вхождение образца в текст, то существенно ускорить работу алгоритма могут пометки о посещённости узла, т.е. если узел посещён, то не переходить по сжатым суффиксным ссылкам. Вместо хранения пометок можно просто сбрасывать сжатую суффиксную ссылку.

Версия 03:51, 14 марта 2011

Задача алгоритма

Найти для каждого образца из заданного множества образцов все его вхождения в текст за время [math]O(m+n+a)[/math], где [math]m[/math] - суммарная длина образцов, [math]n[/math] - длина текста, [math]a[/math] - размер ответа (количество пар). В худшем случае [math]a=nk[/math], но он случается редко.

Шаг 1

Строим бор из образцов. См. Бор.
Построение выполняется за время [math]O(m)[/math], где [math]m[/math] - суммарная длина образцов.

Шаг 2

Превращаем бор в автомат.
Узлы бора становятся состояниями автомата; корень - начальное состояние.
Узлы бора, в которых заканчиваются образцы, становятся терминалами.

Для переходов по автомату заведём в узлах несколько функций:
1) [math]parent(u)[/math] - возвращает родителя вершины [math]u[/math];
2) [math]\pi(u) = \delta(\pi(parent(u)), c)[/math] - суффиксная ссылка; здесь [math]u[/math] - сын [math]parent(u)[/math] по символу [math]c[/math];
3) [math]\delta(u, c) = \begin{cases} v\text{, if $v$ is son by symbol $c$ in trie;}\\ \delta(\pi(u), c)\text{, else.} \end{cases}[/math] - функция перехода.

Суффиксная ссылка [math]\pi(u) = v[/math], если [math][v][/math] - максимальный суффикс [math][u][/math], [math][v]\neq[u][/math]. Обозначение: [math][u][/math] - слово, приводящее в вершину [math]u[/math] в боре.
Функции перехода и суффиксные ссылки можно найти либо алгоритмом обхода в глубину с ленивыми вычислениями, либо с помощью алгоритма обхода в ширину.

Шаг 3

Построение сжатых суффиксных ссылок.
[math]up(u) = \begin{cases} \pi(u)\text{, if $\pi(u)$ is terminal;}\\ \emptyset\text{, if $\pi(u)$ is root;}\\ up(\pi(u))\text{, else.} \end{cases}[/math] - сжатая суффиксная ссылка, т.е. ближайшее допускающее состояние (терминал) перехода по суффиксным ссылкам.

Сжатые суффиксные ссылки могут отыскиваться при помощи ленивой рекурсии.

Использование автомата

По очереди просматриваем символы текста. Для очередного символа [math]c[/math] переходим из текущего состояния [math]u[/math] в состояние, которое вернёт функция [math]\delta(u, c)[/math]. Оказавшись в новом состоянии, отмечаем по сжатым суффиксным ссылкам образцы, которые нам встретились и их позицию (если требуется). Если новое состояние является терминалом, то соответствующие ему образцы тоже отмечаем.
Примечание. Если требуется найти только первое вхождение образца в текст, то существенно ускорить работу алгоритма могут пометки о посещённости узла, т.е. если узел посещён, то не переходить по сжатым суффиксным ссылкам. Вместо хранения пометок можно просто сбрасывать сжатую суффиксную ссылку.