Изменения

Перейти к: навигация, поиск
м
rollbackEdits.php mass rollback
== Идея построения суффиксного массива ==
Согласно [[Суффиксный массив|определению]] суффиксного массива, для его построения достаточно отсортировать все суффиксы строки. Заменим сортировку суффиксов строки <tex>\alpha</tex> на сортировку циклических сдвигов строки <tex>\alpha\$</tex>, где символ <tex>\$</tex> строго меньше любого символа из <tex>\alpha</tex>. Тогда если в упорядоченных циклических сдвигах отбросить суффикс, начинающийся на <tex>\$</tex>, то получим получатся упорядоченные суффиксы исходной строки <tex>\alpha</tex>. В дальнейшем положим <tex>|\alpha\$| = N n </tex> (заметим, что все циклические сдвиги также длины имеют длину <tex>Nn</tex>), а также <tex>\alpha\$ = s</tex>.
== Алгоритм за O(N^2 log(N)) (наивно) Наивный алгоритм ==
Данный алгоритм достаточно тривиален. Отсортируем все циклические сдвиги строки <tex>\alpha\$</tex> , воспользовавшись любым известным ранее методом логарифмической сортировки (например "сортировка слиянием"). Тогда время на сравнение любых двух циклических сдвигов будет осуществляться за <tex>O(Nn)</tex> и суммарная сложность алгоритмы алгоритма составит <tex>O(Nn^2\log(N)n)</tex>.
=== Псевдокод ===
'''int[]''' sufArray('''string''' s) suf <tex>\leftarrow \= {0, 1, \dots, |.. s|\.length}</tex> '''sort''' (suf, compare) '''return''' suf
'''compareorder''' compare(<tex>j_1</tex>, <tex>j_2</tex>) '''forint''' <tex>i</tex> = 0 j1, '''toint''' <tex>|s|</tex> j2) '''dofor'''i = 0 .. s.length '''if''' (s[(<tex>j_1j1 +i</tex>) '''mod''' <tex>|s|</tex>.length] > s[(<tex>j_2j2 +i</tex>) '''mod''' <tex>|s|</tex>.length]) '''return''''ret'GT'' 1 '''if''' (s[(<tex>j_1j1 +i</tex>) '''mod''' <tex>|s|</tex>.length] < s[(<tex>j_2j2 +i</tex>) '''mod''' <tex>|s|</tex>.length]) '''retreturn''' -1''LT'' '''return''''ret'EQ'' 0
== Алгоритм за O(N log^2(N)) (хэши) , использующий хеши ==
Данный алгоритм является некоторым улучшением предыдущего. Основная цель {{- --}} сократить оценку времени сравнения двух циклических сдвигов до <tex>O(\log(n))</tex>, тогда мы по аналогии с предыдущим алгоритмом получим оценку <tex>O(N n \log^2(N)n)</tex>. У нас есть возможность быстро сравнивать подстроки на равенство подстроки используя метод, описанный в [[Поиск_подстроки_в_строке_с_использованием_хеширования._Алгоритм_Рабина-Карпа | здесьалгоритме Рабина-Карпа ]].
Далее пусть Пусть нам необходимо сравнить два циклических сдвига <tex>s[i_1..i_1-1]</tex> и <tex>s[i_2..i_2-1]</tex>. Найдем сначала их наибольший общий префикс (<tex>lcp(i_1,i_2)</tex>), для этого будем использовать двоичный поиск по длине совпадающего префикса, а проверку осуществлять с помощью посчитанных хэшей хешей префиксов. Поскольку циклический сдвиг состоит из суффикса и префикса <tex>suf + pref</tex> исходной строки, то с помощью двух хешей префиксов исходной строки можно найти хеш <tex>suf</tex> или префикса <tex>suf</tex>. Таким образом можно найти хеш префикса циклического сдвига.
 Если оказалось, что <tex>lcp(i_1,i_2) = Nn</tex>, то строки равны. Если же <tex>lcp(i_1,i_2) < Nn</tex>, то символы <tex>s[i_1 + lcp]</tex> и <tex>s[i_2+lcp]</tex> точно различаются, и их сравнение позволяет сделать вывод, какой из циклических сдвигов меньше в лексикографическом порядке. И так Итак, двоичный поиск работает за <tex>O(\log(N)n)</tex> , остальные операции требуют константного времени, получаем оценку времениследовательно, время, необходимого необходимое на сравнение двух циклических сдвигов , оценивается как <tex>O(\log(N)n)</tex>.
=== Псевдокод ===
'''int[]''' sufArray('''string''' s) suf <tex>\leftarrow \= {0, 1, \dots, |.. s|\.length}</tex> '''sort''' (suf, compare) '''return''' suf
'''order'''compare(''' (<tex>j_1</tex>int''' j1, <tex>j_2</tex>'''int''' j2) same <tex>\leftarrow</tex> = '''lcp'''(<tex>j_1</tex>j1, <tex>j_2</tex>j2) '''retif''' s[j1 + same] <tex>j_1</tex> s[j2 + same] - '''return''' ''LT'' '''else if''' s[<tex>j_2</tex> j1 + same] == s2[j2 + same] '''return''' ''EQ'' '''else''' '''return''' ''GT''
'''lcpint''' lcp(<tex>j_1</tex>j1, <tex>j_2</tex>j2) <tex>l</tex> <tex>\leftarrow</tex> <tex>= -1</tex> <tex>r</tex> <tex>\leftarrow</tex> <tex>|S|= s.length +1</tex> '''while''' (<tex>r - l > 1</tex>) <tex>m</tex> <tex>\leftarrow</tex> <tex>= (r + l) / 2</tex> '''if''' (hash[<tex>j_1\dots j_1 j1 .. j1 +m</tex>] == hash[<tex>j+2\dots j_2 j2 .. j2 + m</tex>]) <tex> l \leftarrow = m </tex>
'''else'''
<tex> r \leftarrow = m </tex> '''retreturn''' <tex>l</tex>
== Алгоритм за O(N log^2(N)) (, использующий префиксы циклических сдвигов) ==
Этот алгоритм сильно отличается от двух предыдущих и от него не сложно несложно перейти к алгоритму за <tex>O(N n \log(N)n)</tex>. И так Итак, основная идея: на каждом шаге будем сортировать префиксы циклических сдвигов длины <tex>1,2,4,..., 2^{\lceil \log_2(n)\rceil}</tex>. Еще одно важное дополнение: после каждой фазы, каждому префиксу циклического сдвига <tex>s[i..i-1]</tex> будет присваиваться номер класса эквивалентности <tex>c[i]</tex> среди этих префиксов. Причем классы эквивалентности должны быть пронумерованы в лексикографическом порядке соответствующих представителей. Сначала легко можно отсортировать за <tex>O(n \log n)</tex> префиксы длины <tex>1</tex>, то есть символы. А номера классов поставить в соответствии с порядковым номером символа в алфавите. Рассмотрим теперь переход от префиксов длины <tex>l</tex> к префиксам длины <tex>2l</tex>. Научимся сравнивать два префикса длины <tex>2l</tex> за <tex>O(1)</tex>: Пусть даны префиксы <tex>s[i..i+2l-1]</tex>, <tex>s[j..j+2l-1]</tex>, сравним сначала их левые половинки, использовав значения <tex>c[i], c[j]</tex> с предыдущего шага, если <tex>c[i]\neq c[j]</tex>, то префиксы соотносятся так как же, как <tex>c[i]</tex> и <tex> c[j]</tex>, если <tex>c[i]=c[j]</tex>, то переходим к сравнению <tex>c[i+l]</tex> и <tex> c[j+l]</tex>. Итак, отсортировать префиксы длины <tex>2l</tex> можно за <tex>O(n\log n)</tex>. Вычислить новые <tex>c[i]</tex> можно просто пробежавшись в лексикографическом порядке по префиксам, и увеличивая номер соответствующего класса на <tex>1</tex>, если текущий префикс не совпадает с предыдущим (сравнивать с помощью старых <tex>c[i], c[i+l]</tex>). После шага <tex>l =2^{\lceil \log_2 n\rceil} \geqslant n</tex> все циклические сдвиги будут отсортированы. Всего шагов <tex>O(\log n)</tex>, каждый шаг проводится за <tex>O(n \log n)</tex>, итоговая асимптотика <tex>O(n \log^2 n)</tex>. Схожая идея используется и в [[Алгоритм цифровой сортировки суффиксов циклической строки|алгоритме цифровой сортировки суффиксов циклической строки]], который имеет лучшую асимптотику.=== Псевдокод === '''int[]''' suf_array('''string''' s) suf = {0, 1 .. s.length} '''sort'''(suf, compare1) c = {s[0], s[1] .. s[s.length - 1]} '''for''' l = 1 .. 2^('''ceil'''('''log2'''(n)) - 1) '''step''' l *= 2 '''sort'''(suf, compare2) c'[suf[0]] = 0 '''for''' i = 1 .. s.length - 1 l1 = suf[i - 1] r1 = suf[i - 1] + l l2 = suf[i] r2 = suf[i] + l '''if''' c[l1] <tex>\neq</tex> c[l2] '''or''' c[r1] <tex>\neq</tex> c[r2] c'[suf[i]] = c'[suf[i - 1]] + 1 '''else''' c'[suf[i]] = c'[suf[i - 1]] c = c' '''return''' suf '''order''' compare1('''int''' j1, '''int''' j2) '''if''' s[j1] < s[j2] '''return''' ''LT'' '''else if''' s[j1] == s[j2] '''return''' ''EQ'' '''else''' '''return''' ''GT'' '''order''' compare2('''int''' j1, '''int''' j2) '''if''' c[j1] <tex>\neq</tex> c[j2] '''return''' '''compare'''(c[j1], c[j2]) '''else''' '''return''' '''compare'''(c[j1 + l], c[j2 + l])
В начале легко можно отсортировать за <tex>O(N log(N))</tex> префиксы длины <tex>1</tex>, т.е. символы. А номера классов поставить в соответствии с порядковым номером символа в алфавите==См.также==* [[Суффиксный массив]]* [[Алгоритм цифровой сортировки суффиксов циклической строки]]
Рассмотрим теперь переход от префиксов длины <tex>l</tex> к префиксам длины <tex>2l</tex>. Научимся сравнивать два префикса длины <tex>2l</tex> за <tex>O(1)</tex>: Пусть даны префиксы <tex>s[i..i+2l-1]</tex>, <tex>s[j..j+2l-1]</tex>, сравним сначала их левые половинки, использовав значения <tex>c[i], c[j]</tex> с предыдущего шага, если <tex>c[i]\neq c[j]</tex>, то префиксы соотносятся так как же, как <tex>c[i]</tex> и <tex> c[j]</tex>, если <tex>c[i]=c=Источники информации==[j]</tex>, то переходим к сравнению <tex>c[i+l]<http:/tex> и <tex> c[j+l]</tex>en. И так отсортировать префиксы длины <tex>2l</tex> можно за <tex>O(Nlog(n))</tex>wikipedia. Вычислить новые <tex>c[i]<org/tex> можно легко просто пробежавшись в лексикографическом порядке по префиксам, и увеличивая значение соответствующего класса на <tex>1<wiki/tex> если текущий префикс не совпадает с предыдущим (сравнивать с помощью старых <tex>c[i], c[i+lSuffix_array#Construction_Algorithms Wikipedia — Suffix array construction algorithms]</tex>).
После шага <tex>l =2^{\lceil log_2(n)\rceil} \ge N</tex>. Все циклические сдвиги будут отсортированы. Всего шагов <tex>O(log(N))</tex>, каждый шаг проводится за <tex>O(N log(n))</tex>, итоговая асимптотика <tex>O(N log^2(N))</tex>.[[Категория:Алгоритмы и структуры данных]][[Категория:Суффиксный массив]]
1632
правки

Навигация