Rake-Compress деревья — различия между версиями
(→Источники информации) |
|||
Строка 236: | Строка 236: | ||
* [https://en.wikipedia.org/wiki/Parallel_Tree_Contraction Wikipedia {{---}} Parallel Tree Contraction] | * [https://en.wikipedia.org/wiki/Parallel_Tree_Contraction Wikipedia {{---}} Parallel Tree Contraction] | ||
* [https://github.com/BorysMinaiev/bachelor/blob/master/thesis_v2.pdf Б. Ю. Минаев {{---}} Реализация динамических <tex>\mathrm{Rake-Compress}</tex> деревьев в случае отсутствия ограничения на степени вершин] | * [https://github.com/BorysMinaiev/bachelor/blob/master/thesis_v2.pdf Б. Ю. Минаев {{---}} Реализация динамических <tex>\mathrm{Rake-Compress}</tex> деревьев в случае отсутствия ограничения на степени вершин] | ||
+ | * [http://www.cs.cmu.edu/~jvittes/rc-trees Acar, Blelloch, and Vittes {{---}} RC-Tree implementation] | ||
* [http://www.cs.princeton.edu/~rwerneck/papers/Wer06-dissertation.pdf R. Werneck {{---}} Design and Analysis of Data Structures for Dynamic Trees] | * [http://www.cs.princeton.edu/~rwerneck/papers/Wer06-dissertation.pdf R. Werneck {{---}} Design and Analysis of Data Structures for Dynamic Trees] | ||
* G. L. Miller, J. H. Reif {{---}} Parallel Tree Contraction, Journal of Advances in Computer Research Volume 5, 1989 | * G. L. Miller, J. H. Reif {{---}} Parallel Tree Contraction, Journal of Advances in Computer Research Volume 5, 1989 |
Версия 23:12, 10 мая 2016
Задача, которая решается с помощью динамических деревьев, формулируется следующим образом. Необходимо поддерживать лес деревьев и выполнять на нем следующие операции:
- добавить ребро . Вершина должна быть корнем некоторого дерева. Вершины и должны находиться в разных деревьях,
- удалить ребро . Ребро должно присутствовать в графе,
- некоторый запрос относительно структуры дерева.
Содержание
Описание
лес деревьев и поддерживает следующие операции:
Tree — структура данных, которая хранит- — все листья дерева сжимаются к своим родителям,
- — выбирается и объединяется некоторое множество несмежных друг с другом вершин, имеющих ровно одного сына.
Идея
К лесу корневых деревьев поочередно применяются операции
и до тех пор, пока существует хотя бы одна несжатая вершина.Рассмотрим, как изменяется количество вершин в дереве после применения к нему операций
Разобьём все вершины дерева на три группы:
- — входящая степень равна нулю,
- — входящая степень равна одному,
- — входящая степень больше одного.
Лемма (1): |
. |
Доказательство: |
Докажем по индукции по высоте дерева.
|
Заметим, что для леса деревьев лемма также справедлива.
Лемма (2): |
После применения операций и к лесу, математическое ожидание количества вершин в нём не превосходит от их исходного числа. |
Доказательство: |
Математическое ожидание количества удаленных вершин |
Теорема: |
Математическое ожидание количества операций и , которые будут выполнены до полного сжатия дерева, равно , где — общее количество вершин. |
Доказательство: |
Из леммы 2 известно, что после каждой итерации применения операций | и число вершин в среднем уменьшается в константное число раз. Значит, количество итераций в среднем ограничено .
Реализация
Хранение
Для того, чтобы отвечать на запросы относительно структуры леса необходимо сохранить информацию о том, как происходил процесс сжатия леса. Для этого будем хранить таблицу, в каждой строке которой записана информация о структуре леса после выполнения операций. Каждая клетка таблицы будет хранить информацию о вершине после выполнения операций
Пример таблицы для следующей последовательности операций:
Шаг | Операция | ||||
---|---|---|---|---|---|
4 | Родитель: — Дети: |
— | — | — | |
3 | Родитель: — Дети: |
— | Родитель: Дети: |
— | |
2 | Родитель: — Дети: |
Родитель: Дети: |
Родитель: Дети: |
— | |
1 | Родитель: — Дети: |
Родитель: Дети: |
Родитель: Дети: |
Родитель: Дети: |
Для того, чтобы выбирать множество вершин для применения операции будем использовать следующий метод: для каждой вершины с помощью генератора псевдослучайных чисел выберем случайный бит. Вершина добавляется в множество, если у нее ровно один ребенок, она не является корнем и биты, которые были сгенерированы для нее, ребенка и родителя равны 0, 1 и 1 соответственно.
Рассмотрим более подробно, как необходимо хранить клетки таблицы
На самом деле, множество детей хранится для того, чтобы определять, можно ли сжать вершину. Если детей у вершины больше одного, то ее точно нельзя сжать. Если у неё нет детей, то ее можно сжать только во время операции . Чтобы определить можно ли применить операцию к вершине, в том случае, когда у нее один ребёнок, нужно узнать, как бит был сгенерирован на текущей итерации для ребёнка. Для этого необходимо знать номер вершины-ребёнка. Значит, необходимо уметь определять, кто находится в множестве только в том случае, если в нём не более одного элемента. Поэтому, всю информацию о множестве можно хранить с помощью двух величин — хранить количество элементов в множестве и сумму их номеров.
Если вершина является корнем, то в качестве ее родителя будем хранить ее номер. Кроме того необходимо хранить изменения, которые произойдут с клеткой при переходе к следующему слою: будем хранить, кто должен стать новым родителем, на сколько изменится количество детей, а также как изменится сумма их номеров. Все это необходимо для того, чтобы обрабатывать каждую изменившуюся клетку за .
Псевдокод хранения клетки таблицы:
- — номер вершины,
- — родитель вершины,
- — количество детей вершины,
- — сумма номеров детей,
- — новый родитель вершины после изменений,
- и — изменения, произведенные с полями и соответственно.
struct Cell: int id, parent, cntChild, sumChild int newParent, diffCntChild, diffSumChild func applyChanges(): parent = newParent sumChild += diffSumChild cntChild += diffCntChild diffCntChild = diffSumChild = 0 func addChild(v): diffCntChild++ diffSumChild += v func removeChild(v): diffCntChild-- diffSumChild -= v
Для хранения
дерева будем использовать следующие данные:- — список клеток, которые ей соответствуют, для каждой вершины,
- — генератор псевдослучайных чисел,
- — счётчик количества примененных операций по изменению структуры леса,
- — массив, в котором для каждой вершины запишем номер последней операции, при обработки которой была изменена хотя бы одна клетка, которая соответствуют вершине: это позволит эффективно узнавать, была ли вершина уже помечена как поменявшаяся или нет.
struct RCTree(n: int): rand = RandBitsGenerator() time = 0 for i = 0 to n lastUpdateTime[i] = 0 cells[i] = []
Кроме запросов о структуре леса,
деревья можно использовать для подсчета значений некоторых функций. Например, каждой вершине можно сопоставить некоторое значение и узнавать, чему равна сумма значений всех вершин, которые находятся в поддереве. Для этого в клетках таблицы дерева необходимо хранить не только состояние вершины, но и значение функции, посчитанной на части дерева, которое уже было сжато в вершину. Если функция является аддитивной, то ее пересчет аналогичен пересчету множества детей вершины. Так, если некоторая вершина сжимается к родителю, то в соответствующей родителю клетке необходимо обновить значение функции. При добавлении и удалении ребер необходимо в изменившихся клетках пересчитывать значение функции.Построение
Рассмотрим, как работает алгоритм построения
дерева. Будем строить таблицу по строкам. В каждый момент будем хранить множество вершин, которые еще не были сжаты, и перестраивать следующий слой. Также будем делать операции и одновременно. Чтобы определить, нужно ли сжимать вершину, воспользуемся следующим алгоритмом:bool shouldRemoveVertex(c: Cell, rand, layer: int): if c.cntChild == 0 return true if c.cntChild > 1 or c.parent == c.id return false if getCellForVertex(c.sumChild).cntChild == 0 return false if rand.getBit(c.id, layer) == 0 and rand.getBit(c.sumChild, layer) == 1 and rand.getBit(c.parent, layer) == 1: return true return false
Таким образом, алгоритм построения дерева выглядит следующим образом:
func build(parent: int[]): n = parent.size alive =layer = 0 for i = 0 to n cells[i].add(Cell(parent[i])) while nextAlive = for c = getCellForVertex(v) // получить клетку таблицы, соответствующую вершине if shouldRemoveVertex(c, rand, layer) if c.cntChild == 1 getCellForVertex(c.sumChild).newParent = c.parent getCellForVertex(c.parent).addChild(c.sumChild) if c.parent v getCellForVertex(c.parent).remove(v) else nextAlive.add(v) alive = nextAlive for newCell = getCellForVertex(v).clone().appleChanges() cells[v].add(newCell) layer++
Операции удаления и добавления ребра
Как только некоторая вершина помечается как изменившаяся, отменим её действие на таблицу. А именно, найдем момент времени, когда вершина сжимается к родителю. Рассмотрим, какие вершины поменяются при сжатии данной. Это ее родитель (если он есть), а также сын (если он есть). Для каждой из этих вершин поменяем значения изменений, которые необходимо применить к состоянию. Также пометим, что эти вершины поменялись на этом слое. Для этого на каждом слое будем хранить список вершин, которые на нем поменялись. А перед тем как обрабатывать очередной слой будем добавлять в множество изменившихся вершин вершины из соответствующего списка. Кроме удаления эффекта от изменившихся вершин также необходимо и добавить правильный эффект. Для этого будем для каждой из из- менившихся вершин определять, как ее состояние меняется при переходе к следующему слою. Если вершина сжимается к ее родителю, то пометим родителя и ребенка (если он есть) и поменяем изменение, которое хранится в соответствующих клетках. А для пересчета состояния клеток воспользуемся значениями изменений, которые сохранены в клетках.
Рассмотрим, что происходит с таблицей при изменении одного ребра. Основная идея заключается в том, чтобы научится пересчитывать все изменения таблицы за время пропорциональное их количеству. Для этого будем эффективно поддерживать множество изменившихся клеток. В момент, когда вершина помечается, как изменившаяся, найдем, как она влияет на таблицу и отменим это влияние.
Для начала необходимо найти момент времени, когда вершина сжимается. В этот момент она влияет на не более чем две вершины. Изменим значения , и нужным образом. Также необходимо добавить эти вершины в множество изменившихся (в момент, когда будет обработан соответствующий слой). Поэтому, для каждого слоя еще будем хранить список вершин, которые должны быть помечены перед обработкой слоя.
Алгоритм обновления дерева:
func changeTree(: Edge): time = time + 1 affected = markAffected(u) // пусть из дерева было удалено ребро markAffected(v) cells[u].parent = u cells[v].cntChild-- cells[v].sumChild -= u layer = 0 while for markAffected(v) for c = getCellForVertex(v) if shouldRemoveVertex(v) cells[v].size = layer + 1 if c.cntChild == 1 getCellForVertex(c.sumChild).newParent = c.parent getCellForVertex(c.parent).addChild(c.sumChild) markAffected(c.sumChild) if c.parent v getCellForVertex(c.parent).removeChild(v) markAffected(c.parent) affected.remove(v) for newCell = getCellForVertex(v).clone().applyChanges() cells[v][layer + 1] = newCell layer++ func markAffected(v: int): if lastUpdateTime[v] == time return // вершина уже помечена lastUpdateTime[v] = time affected.add(v) removeEffectOfVertex(v) func removeEffectOfVertex(v: int): layer = cells[v].size c = cells[v][layer] if c.parent == v return cells[c].parent.removeChild(v) if c.cntChild == 1 cells[c.parent].addChild(c.sumChild) cells[c.sumChild].newParent = v
Возможность параллельного построения
Операции [1] в случае наличия процессоров.
и можно выполнять параллельно для всех вершин. Если предположить, что множество детей можно пересчитывать за , то дерево можно построить за в модели PRAMСм. также
Примечания
Источники информации
- Wikipedia — Parallel Tree Contraction
- Б. Ю. Минаев — Реализация динамических деревьев в случае отсутствия ограничения на степени вершин
- Acar, Blelloch, and Vittes — RC-Tree implementation
- R. Werneck — Design and Analysis of Data Structures for Dynamic Trees
- G. L. Miller, J. H. Reif — Parallel Tree Contraction, Journal of Advances in Computer Research Volume 5, 1989