Алгоритм Касаи и др. — различия между версиями

Материал из Викиконспекты
Перейти к: навигация, поиск
Строка 4: Строка 4:
  
 
==Обозначения==
 
==Обозначения==
Задана строка <tex>A</tex>. Тогда <tex>A_{i}</tex> {{---}} суфикс строки <tex>A</tex>, начинающийся в <tex>i</tex>-ом символе. Пусть задан суфиксный массив <tex>Pos</tex>. Для вычисления <tex>LCP</tex> будем использовать промежуточный массив <tex>Rank</tex>. Массив <tex>Rank</tex> определен как обратный к массиву <tex>Pos</tex>. Он может быть получен немедленно, если задан массив <tex>Pos</tex>. Если <tex>Pos[k] = i</tex>, то <tex>Rank[i] = k</tex>.  
+
Задана строка <tex>A</tex>. Тогда <tex>A_{i}</tex> {{---}} суффикс строки <tex>A</tex>, начинающийся в <tex>i</tex>-ом символе. Пусть задан суффиксный массив <tex>Pos</tex>. Для вычисления <tex>LCP</tex> будем использовать промежуточный массив <tex>Rank</tex>. Массив <tex>Rank</tex> определен как обратный к массиву <tex>Pos</tex>. Он может быть получен немедленно, если задан массив <tex>Pos</tex>. Если <tex>Pos[k] = i</tex>, то <tex>Rank[i] = k</tex>.  
  
 
<tex>Height[i]</tex> {{---}} длина наибольшего общего префикса <tex>i</tex> и <tex>i-1</tex> строк в суффиксном массиве (<tex>Pos[i]</tex> и <tex>Pos[i-1]</tex> соответственно).
 
<tex>Height[i]</tex> {{---}} длина наибольшего общего префикса <tex>i</tex> и <tex>i-1</tex> строк в суффиксном массиве (<tex>Pos[i]</tex> и <tex>Pos[i-1]</tex> соответственно).
Строка 10: Строка 10:
 
==Некоторые свойства <tex>LCP</tex>==
 
==Некоторые свойства <tex>LCP</tex>==
 
===Факт №1===
 
===Факт №1===
<tex>LCP</tex> между двумя суфиксами {{---}} это минимум <tex>LCP</tex> всех пар смежных суфиксов между ними в суфиксном массиве <tex>Pos</tex>. То есть <tex>LCP(A_{Pos[x]}, A_{Pos[z]}) = min_{x < y \le z}(LCP(A_{Pos[y - 1]},A_{Pos[y]})</tex>.
+
<tex>LCP</tex> между двумя суффиксами {{---}} это минимум <tex>LCP</tex> всех пар смежных суффиксов между ними в суффиксном массиве <tex>Pos</tex>. То есть <tex>LCP(A_{Pos[x]}, A_{Pos[z]}) = min_{x < y \le z}(LCP(A_{Pos[y - 1]},A_{Pos[y]})</tex>.
Отсюда следует, что <tex>LCP</tex> пары соседних суфиксов в массиве <tex>Pos</tex> больше или равно <tex>LCP</tex> пары суфиксов, окружающих их.
+
Отсюда следует, что <tex>LCP</tex> пары соседних суффиксов в массиве <tex>Pos</tex> больше или равно <tex>LCP</tex> пары суффиксов, окружающих их.
  
 
{{Утверждение
 
{{Утверждение
Строка 18: Строка 18:
  
 
===Факт №2===
 
===Факт №2===
Если значение <tex>LCP</tex> между парой соседних суфиксов, смежных в массиве <tex>Pos</tex> больше <tex>1</tex>, то лексикографический порядок суффиксов сохранится, если удалить первый символ каждого суффикса.<br>
+
Если значение <tex>LCP</tex> между парой соседних суффиксов, смежных в массиве <tex>Pos</tex> больше <tex>1</tex>, то лексикографический порядок суффиксов сохранится, если удалить первый символ каждого суффикса.<br>
 
{{Утверждение
 
{{Утверждение
 
|statement=
 
|statement=
Строка 29: Строка 29:
 
}}
 
}}
  
Теперь рассмотрим следующую задачу: расчитать <tex>LCP</tex> между суфиксом <tex>A_{i}</tex> и его смежным суфиксом в массиве <tex>Pos</tex>, при условии, что значение <tex>LCP</tex> между <tex>A_{i-1}</tex> и его смежным суфиксом известны. Для удобства записи пусть <tex>p=Rank[i - 1]</tex> и <tex>q = Rank[i]</tex>. Так же пусть <tex>j - 1 = Pos[p-1]</tex> и <tex>k = Pos[q - 1]</tex>. Проще говоря, мы хотим посчитать <tex>Height[q]</tex>, когда задано <tex>Height[p]</tex>
+
Теперь рассмотрим следующую задачу: рассчитать <tex>LCP</tex> между суффиксом <tex>A_{i}</tex> и его смежным суффиксом в массиве <tex>Pos</tex>, при условии, что значение <tex>LCP</tex> между <tex>A_{i-1}</tex> и его смежным суффиксом известны. Для удобства записи пусть <tex>p=Rank[i - 1]</tex> и <tex>q = Rank[i]</tex>. Так же пусть <tex>j - 1 = Pos[p-1]</tex> и <tex>k = Pos[q - 1]</tex>. Проще говоря, мы хотим посчитать <tex>Height[q]</tex>, когда задано <tex>Height[p]</tex>
  
 
{{Лемма|statement=
 
{{Лемма|statement=

Версия 16:49, 21 апреля 2012

Алгоритм Касаи (Аримуры-Арикавы-Касаи-Ли-Парка) — алгоритм, позволяющий за линейное время вычислить значения наибольших общих префиксов для соседних циклических сдвигов строки, отсортированных в лексикографическом порядке (largest common prefix, далее [math]LCP[/math]).

Обозначения

Задана строка [math]A[/math]. Тогда [math]A_{i}[/math] — суффикс строки [math]A[/math], начинающийся в [math]i[/math]-ом символе. Пусть задан суффиксный массив [math]Pos[/math]. Для вычисления [math]LCP[/math] будем использовать промежуточный массив [math]Rank[/math]. Массив [math]Rank[/math] определен как обратный к массиву [math]Pos[/math]. Он может быть получен немедленно, если задан массив [math]Pos[/math]. Если [math]Pos[k] = i[/math], то [math]Rank[i] = k[/math].

[math]Height[i][/math] — длина наибольшего общего префикса [math]i[/math] и [math]i-1[/math] строк в суффиксном массиве ([math]Pos[i][/math] и [math]Pos[i-1][/math] соответственно).

Некоторые свойства [math]LCP[/math]

Факт №1

[math]LCP[/math] между двумя суффиксами — это минимум [math]LCP[/math] всех пар смежных суффиксов между ними в суффиксном массиве [math]Pos[/math]. То есть [math]LCP(A_{Pos[x]}, A_{Pos[z]}) = min_{x \lt y \le z}(LCP(A_{Pos[y - 1]},A_{Pos[y]})[/math]. Отсюда следует, что [math]LCP[/math] пары соседних суффиксов в массиве [math]Pos[/math] больше или равно [math]LCP[/math] пары суффиксов, окружающих их.

Утверждение:
[math]LCP(A_{Pos[y - 1]}, A_{Pos[y]}) \le LCP(A_{Pos[x]},A_{Pos[z]}), x \lt y \le z[/math]

Факт №2

Если значение [math]LCP[/math] между парой соседних суффиксов, смежных в массиве [math]Pos[/math] больше [math]1[/math], то лексикографический порядок суффиксов сохранится, если удалить первый символ каждого суффикса.

Утверждение:
Если [math]LCP(A_{Pos[x-1]} , A_{Pos[x]} ) \gt 1[/math], тогда [math]Rank[Pos[x - 1] + 1] \lt Rank[Pos[x] + 1][/math]

Факт №3

В этом же случае, значение [math]LCP[/math] между [math]A_{Pos[x-1]+1}[/math] и [math]A_{Pos[x]+1}[/math] на один меньше значения [math]LCP[/math] между [math]A_{Pos[x-1]}[/math] и [math]A_{Pos[x]}[/math].

Утверждение:
Если [math]LCP(A_{Pos[x-1]} , A_{Pos[x]} ) \gt 1[/math], тогда [math]LCP(A_{Pos[x-1]+1} , A_{Pos[x]+1}) = LCP(A_{Pos[x-1]} , A_{Pos[x]} ) - 1[/math]

Теперь рассмотрим следующую задачу: рассчитать [math]LCP[/math] между суффиксом [math]A_{i}[/math] и его смежным суффиксом в массиве [math]Pos[/math], при условии, что значение [math]LCP[/math] между [math]A_{i-1}[/math] и его смежным суффиксом известны. Для удобства записи пусть [math]p=Rank[i - 1][/math] и [math]q = Rank[i][/math]. Так же пусть [math]j - 1 = Pos[p-1][/math] и [math]k = Pos[q - 1][/math]. Проще говоря, мы хотим посчитать [math]Height[q][/math], когда задано [math]Height[p][/math]

Лемма:
Если [math]LCP(A_{j-1}, A_{i-1}) \gt 1[/math], тогда [math]LCP(A_k,A_i) \le LCP(A_j,A_i)[/math]
Доказательство:
[math]\triangleright[/math]
Так как [math]LCP(A_{j−1},A_{i−1}) \gt 1[/math], имеем [math]Rank[j] \lt Rank[i][/math] из факта №2. Так как [math]Rank[j] \le Rank[k] = Rank[i] - 1[/math], имеем [math]LCP(A_{k} , A_{i}) \ge LCP(A_{j} , A_{i})[/math] из факта №1
[math]\triangleleft[/math]
Теорема:
Если [math]Height[p] = lcp(A_{j-1}, A_{i-1}) \gt 1[/math], то [math]Height[q] = lcp(A_{k}, A_{i}) \ge Height[p] - 1[/math]
Доказательство:
[math]\triangleright[/math]
[math]LCP(A_{k}, A_{i}) \ge LCP(A_{j} , A_{i})[/math](из Леммы) = [math]LCP(A_{j-1}, A_{i−1}) - 1[/math] (из факта №3).
[math]\triangleleft[/math]

Описание алгоритма

Таким образом, начиная проверять [math]lcp[/math] для текущего суффикса не с первого символа, а с указанного, можно за линейное время построить [math]lcp[/math]. Покажем, что построение [math]lcp[/math] таким образом действительно требует [math]O(N)[/math] времени. Действительно, на каждой итерации текущее значение [math]lcp[/math] может быть не более чем на единицу меньше предыдущего. Таким образом, значения [math]lcp[/math] в сумме могут увеличиться не более, чем на [math]2N[/math] (с точностью до константы). Следовательно, алгоритм построит [math]lcp[/math] за [math]O(N)[/math].

Источники

1. Алгоритм Касаи.
2. T.Kasai, G.Lee, H.Arimura, S.Arikawa, K.Park - Linear-Time Longest-Common-Prefix Computation in Suffix Arrays and Its Application.