Алгоритм Райта — различия между версиями
Zernov (обсуждение | вклад) (→Псевдокод) |
м (rollbackEdits.php mass rollback) |
||
(не показано 26 промежуточных версий 3 участников) | |||
Строка 1: | Строка 1: | ||
− | '''Алгоритм Райта''' (англ. ''Raita algorithm'') {{---}} алгоритм поиска подстроки в строке, который опубликовал Тим Райта в 1991 году, являющийся модификацией [[Алгоритм Бойера-Мура|алгоритма Бойера-Мура]] и улучшающий его асимптотику | + | '''Алгоритм Райта''' (англ. ''Raita algorithm'') {{---}} алгоритм поиска подстроки в строке, который опубликовал Тим Райта в 1991 году, являющийся модификацией [[Алгоритм Бойера-Мура|алгоритма Бойера-Мура]] и улучшающий его асимптотику. |
==Описание алгоритма== | ==Описание алгоритма== | ||
− | Алгоритм Райта ищет образец <tex>x</tex> в заданном тексте <tex>y</tex> сравнивания их символы. | + | Алгоритм Райта ищет образец <tex>x</tex> в заданном тексте <tex>y</tex>, сравнивания их символы. Окном текста <tex>y</tex> будем называть последовательность символов <tex>i \dots m - i + 1</tex>, где <tex>m</tex> {{---}} длина образца <tex>x</tex>. Сравнение происходит в следующем порядке: |
# '''Последний''' символ образца сравнивается с самым '''правым''' символом окна. | # '''Последний''' символ образца сравнивается с самым '''правым''' символом окна. | ||
# Если они совпадают, то '''первый''' символ сравнивается с самым '''левым''' символом окна. | # Если они совпадают, то '''первый''' символ сравнивается с самым '''левым''' символом окна. | ||
− | # Если они опять совпали, то сравниваются символы, находящиеся | + | # Если они опять совпали, то сравниваются символы, находящиеся в середине образца и окна. |
− | Если все шаги прошли успешно, то начинаем сравнивать образец и текст посимвольно в обычном порядке, начиная с второго с конца символа. В противном случае | + | Если все шаги прошли успешно, то начинаем сравнивать образец и текст посимвольно в обычном порядке, начиная с второго с конца символа. В противном случае вызываем функцию выполнения сдвига плохого символа, которая отработала в стадии препроцессинга. Эта функция аналогична той, которая была использована в фазе препроцессинга [[Алгоритм Бойера-Мура|алгоритма Бойера-Мура]]. Кроме того, в третьем шаге, в зависимости от специфики текста, можно брать не средний символ, а случайный, либо с каким-то определенным индексом. |
==Псевдокод== | ==Псевдокод== | ||
− | Функция поиска индекса первого вхождения сивола в массиве <tex>y</tex> с позиции <tex>fromIndex</tex> до позиции <tex>toIndex</tex> | + | Функция поиска индекса первого вхождения сивола в массиве <tex>y</tex> с позиции <tex> \mathtt{fromIndex}</tex> до позиции <tex> \mathtt{toIndex}</tex>: |
− | '''int''' findFirst('''char'''[] y, '''int''' fromIndex, '''int''' toIndex, '''char''' symbol) | + | '''int''' findFirst('''char'''[] y, '''int''' fromIndex, '''int''' toIndex, '''char''' symbol): |
'''for''' (i = fromIndex .. toIndex) | '''for''' (i = fromIndex .. toIndex) | ||
'''if''' (y[i] == symbol) | '''if''' (y[i] == symbol) | ||
Строка 18: | Строка 18: | ||
'''return''' -1 | '''return''' -1 | ||
− | Проверка, что все символы в <tex>y</tex> с позиции <tex>fromIndex</tex> и до <tex>toIndex</tex> и <tex>x</tex> с начала и до конца совпадают | + | Проверка, что все символы в <tex>y</tex> с позиции <tex>\mathtt{fromIndex}</tex> и до <tex>\mathtt{toIndex}</tex> и <tex>x</tex> с начала и до конца совпадают: |
− | '''boolean''' restEquals('''char'''[] y, '''int''' fromIndex, '''char'''[] x, '''int''' toIndex) | + | '''boolean''' restEquals('''char'''[] y, '''int''' fromIndex, '''char'''[] x, '''int''' toIndex): |
'''for''' (i = fromIndex .. toIndex) | '''for''' (i = fromIndex .. toIndex) | ||
'''if''' (y[i] != x[i - fromIndex]) | '''if''' (y[i] != x[i - fromIndex]) | ||
Строка 25: | Строка 25: | ||
'''return''' true | '''return''' true | ||
− | Стадия препроцессинга (совпадает со стадией препроцессинга в [[Алгоритм Бойера-Мура|алгоритме Бойера-Мура]]) | + | Стадия препроцессинга (совпадает со стадией препроцессинга в [[Алгоритм Бойера-Мура|алгоритме Бойера-Мура]]): |
− | '''int'''[] preBmBc('''char'''[] x, '''int''' m) | + | '''int'''[] preBmBc('''char'''[] x, '''int''' m): |
'''int'''[] result = '''int'''[ASIZE] | '''int'''[] result = '''int'''[ASIZE] | ||
<font color=green>//Где ASIZE {{---}} размер алфавита</font> | <font color=green>//Где ASIZE {{---}} размер алфавита</font> | ||
Строка 35: | Строка 35: | ||
'''return''' result | '''return''' result | ||
− | Основная стадия алгоритма | + | Основная стадия алгоритма: |
− | '''void''' RAITA('''char'''[] x, '''int''' m, '''char'''[] y, '''int''' n) | + | '''void''' RAITA('''char'''[] x, '''int''' m, '''char'''[] y, '''int''' n): |
'''int'''[] bmBc | '''int'''[] bmBc | ||
'''char''' c, firstCh, middleCh, lastCh; | '''char''' c, firstCh, middleCh, lastCh; | ||
Строка 70: | Строка 70: | ||
* Фаза препроцессинга требует <tex>O(m + \sigma)</tex> времени и памяти, где <tex>\sigma</tex> {{---}} размер алфавита. | * Фаза препроцессинга требует <tex>O(m + \sigma)</tex> времени и памяти, где <tex>\sigma</tex> {{---}} размер алфавита. | ||
* В худшем случае поиск требует <tex>O(m \cdot n)</tex> сравнений. | * В худшем случае поиск требует <tex>O(m \cdot n)</tex> сравнений. | ||
− | '''Пример:''' текст, состоящий только из букв <tex>a</tex> и образец <tex>aa..baa</tex>. В таком случае | + | '''Пример:''' текст, состоящий только из букв <tex>a</tex> и образец <tex>aa..baa</tex>. В таком случае <tex>BmBc[a]</tex> будет равен <tex>1</tex>, то есть после каждой фазы сравнений мы будем сдвигаться на <tex>1</tex>. Значит, всего будет <tex>n</tex> фаз сравнений, а каждая фаза отработает за <tex>m - 2</tex>, поскольку расхождение будет только в третьем с конца символе, то мы сравним сначала последний, потом первый, потом средний, а затем пойдем с самого начала, сравнивая все символы подряд. Итого получаем асимптотику <tex>O(m \cdot n)</tex> |
* В лучшем случае требует <tex > \Omega(n / m)</tex> сравнений. | * В лучшем случае требует <tex > \Omega(n / m)</tex> сравнений. | ||
− | '''Пример:''' текст | + | '''Пример:''' текст вида <tex>a..ba..ab..a</tex> и образец <tex>ba..ab</tex>. В таком случае <tex>BmBc[b]</tex> будет равен <tex>m - 1</tex>. Значит, всего будет не более чем <tex>n / (m - 1)</tex> фаз сравнений, а каждая фаза (кроме той, в которой мы нашли вхождение строки) будет работать за <tex>1</tex>, поскольку расхождение будет уже в последних символах. Итого получаем асимптотику <tex > \Omega(n / m)</tex> |
==Сравнение с Алгоритмом Бойера-Мура== | ==Сравнение с Алгоритмом Бойера-Мура== | ||
[[Файл:RaitaComparing.png|350px|thumb|Right|Верхняя кривая {{---}} алгоритм Бойера-Мура, нижняя {{---}} Райта]] | [[Файл:RaitaComparing.png|350px|thumb|Right|Верхняя кривая {{---}} алгоритм Бойера-Мура, нижняя {{---}} Райта]] | ||
− | В своей статье Тим Райта экспериментально проверил ускорение алгоритма на реальных текстах. Тесты были приведены | + | В своей статье Тим Райта экспериментально проверил ускорение алгоритма на реальных текстах. Тесты были приведены в техническом отчете, написанном на английском языке. Длина текста составила <tex>29 550</tex> символов. Использовался '''ASCII''' алфавит (подразумевается теоритический размер алфавита, равный <tex>128</tex>, в тексте было использовано только <tex>85</tex> символов.) Шаблоны длиной <tex>2-20</tex> символов случайно выбирались из текста, а затем проходил их поиск в тексте. (См. рисунок) |
− | Результат показывает ускорение модификации алгоритма на <tex>21-27%</tex> относительно оригинального на всех шаблонах. Шаблон встречался в тексте как минимум один раз (из-за метода его выбора). Однако, результаты теста на шаблонах, которые не встречались в тексте, были очень похожи на верхнюю кривую. Очевидно, что шаблоны, имеющие часто встречающиеся суффиксы, такие как <tex>-ion</tex> или <tex>-ed</tex> вносят наибольший вклад в быстродействие модификации. (В алгоритме Бойера-Мура мы будем идти с конца, пока не найдем различия, то есть произведем сравнение на всем суффиксе, в то время как в алгоритме Райта мы выйдем сразу после несовпадения первых символов). | + | Результат показывает ускорение модификации алгоритма на <tex>21-27\%</tex> относительно оригинального на всех шаблонах. Шаблон встречался в тексте как минимум один раз (из-за метода его выбора). Однако, результаты теста на шаблонах, которые не встречались в тексте, были очень похожи на верхнюю кривую. Очевидно, что шаблоны, имеющие часто встречающиеся суффиксы, такие как <tex>-ion</tex> или <tex>-ed</tex> вносят наибольший вклад в быстродействие модификации. (В алгоритме Бойера-Мура мы будем идти с конца, пока не найдем различия, то есть произведем сравнение на всем суффиксе, в то время как в алгоритме Райта мы выйдем сразу после несовпадения первых символов). |
− | Кроме того, производительность растет с увеличением <tex>m</tex>, поскольку вклад сравнений первого, последнего и среднего символа уменьшается. С другой стороны, производительность ухудшается с уменьшением размера алфавита, поскольку вероятность того, что первый, средний и последний символ из шаблона и текста совпадут, увеличивается. Однако | + | Кроме того, производительность растет с увеличением <tex>m</tex>, поскольку вклад сравнений первого, последнего и среднего символа уменьшается. С другой стороны, производительность ухудшается с уменьшением размера алфавита, поскольку вероятность того, что первый, средний и последний символ из шаблона и текста совпадут, увеличивается. Однако Тим Райта в своей статье пишет, что несмотря на теоритическую возможность ухудшения, на практике, скорее всего, разница будет заметна лишь на очень маленьких алфавитах (например, длины <tex>2</tex>). |
==Пример== | ==Пример== | ||
Пусть нам дана строка <tex>y = GCATCGCAGAGAGTATACAGTACG</tex> и образец <tex>x=GCAGAGAG</tex> | Пусть нам дана строка <tex>y = GCATCGCAGAGAGTATACAGTACG</tex> и образец <tex>x=GCAGAGAG</tex> | ||
− | [[Файл:RaitaPre.png| | + | Построим массив <tex>bmBc</tex>: |
+ | |||
+ | [[Файл:RaitaPre.png|250px]] | ||
+ | |||
+ | Рассмотрим шаги алгоритма: | ||
{| class = "wikitable" | {| class = "wikitable" | ||
! Изображение !! <tex>(j, bmBc[y[j]])</tex> !! Описание | ! Изображение !! <tex>(j, bmBc[y[j]])</tex> !! Описание | ||
|-align="center" | |-align="center" | ||
− | |[[Файл:Raita1.png| | + | |[[Файл:Raita1.png|550px]] |
|<tex>(7, 1)</tex> | |<tex>(7, 1)</tex> | ||
− | | | + | |Сравниванием последние символы, они неравны, поэтому сдвигаемся. |
|-align="center" | |-align="center" | ||
− | |[[Файл:Raita2.png| | + | |[[Файл:Raita2.png|550px]] |
|<tex>(8, 2)</tex> | |<tex>(8, 2)</tex> | ||
|Последние символы совпали, сравниваем первые, сдвигаемся. | |Последние символы совпали, сравниваем первые, сдвигаемся. | ||
|-align="center" | |-align="center" | ||
− | |[[Файл:Raita3.png| | + | |[[Файл:Raita3.png|550px]] |
|<tex>(10, 2)</tex> | |<tex>(10, 2)</tex> | ||
|Последние символы совпали, сравниваем первые, сдвигаемся. | |Последние символы совпали, сравниваем первые, сдвигаемся. | ||
|-align="center" | |-align="center" | ||
− | |[[Файл:Raita4.png| | + | |[[Файл:Raita4.png|550px]] |
|<tex>(12, 2)</tex> | |<tex>(12, 2)</tex> | ||
|Совпали последний, первый и средний символы, пробегаемся по всему шаблону и сравниваем символы. Нашли строчку в тексте. Продолжим работу (для примера, в обычном варианте на этом этапе мы можем выйти, если требуется найти только одно вхождение) и сдвинемся. | |Совпали последний, первый и средний символы, пробегаемся по всему шаблону и сравниваем символы. Нашли строчку в тексте. Продолжим работу (для примера, в обычном варианте на этом этапе мы можем выйти, если требуется найти только одно вхождение) и сдвинемся. | ||
|-align="center" | |-align="center" | ||
− | |[[Файл:Raita5.png| | + | |[[Файл:Raita5.png|550px]] |
|<tex>(14, 1)</tex> | |<tex>(14, 1)</tex> | ||
|Делаем сравнение последних символов, оно неудачно, сдвигаемся. | |Делаем сравнение последних символов, оно неудачно, сдвигаемся. | ||
|-align="center" | |-align="center" | ||
− | |[[Файл:Raita6.png| | + | |[[Файл:Raita6.png|550px]] |
|<tex>(15, 8)</tex> | |<tex>(15, 8)</tex> | ||
|Делаем сравнение последних символов, оно неудачно, сдвигаемся. | |Делаем сравнение последних символов, оно неудачно, сдвигаемся. | ||
|-align="center" | |-align="center" | ||
− | |[[Файл:Raita7.png| | + | |[[Файл:Raita7.png|550px]] |
|<tex>(23, 2)</tex> | |<tex>(23, 2)</tex> | ||
− | |Последние символы совпали, сравниваем первые, сдвигаемся. Строка закончилась, | + | |Последние символы совпали, сравниваем первые, сдвигаемся. Строка закончилась, выходим. |
|- | |- | ||
|} | |} | ||
− | В итоге, чтобы найти одно вхождение образца длиной <tex>m = 8</tex> в образце длиной <tex>n = 24</tex> нам понадобилось <tex>18</tex> сравнений символов | + | В итоге, чтобы найти одно вхождение образца длиной <tex>m = 8</tex> в образце длиной <tex>n = 24</tex>, нам понадобилось <tex>18</tex> сравнений символов. |
==См. также== | ==См. также== |
Текущая версия на 19:29, 4 сентября 2022
Алгоритм Райта (англ. Raita algorithm) — алгоритм поиска подстроки в строке, который опубликовал Тим Райта в 1991 году, являющийся модификацией алгоритма Бойера-Мура и улучшающий его асимптотику.
Содержание
Описание алгоритма
Алгоритм Райта ищет образец
в заданном тексте , сравнивания их символы. Окном текста будем называть последовательность символов , где — длина образца . Сравнение происходит в следующем порядке:- Последний символ образца сравнивается с самым правым символом окна.
- Если они совпадают, то первый символ сравнивается с самым левым символом окна.
- Если они опять совпали, то сравниваются символы, находящиеся в середине образца и окна.
Если все шаги прошли успешно, то начинаем сравнивать образец и текст посимвольно в обычном порядке, начиная с второго с конца символа. В противном случае вызываем функцию выполнения сдвига плохого символа, которая отработала в стадии препроцессинга. Эта функция аналогична той, которая была использована в фазе препроцессинга алгоритма Бойера-Мура. Кроме того, в третьем шаге, в зависимости от специфики текста, можно брать не средний символ, а случайный, либо с каким-то определенным индексом.
Псевдокод
Функция поиска индекса первого вхождения сивола в массиве
с позиции до позиции :int findFirst(char[] y, int fromIndex, int toIndex, char symbol): for (i = fromIndex .. toIndex) if (y[i] == symbol) return i return -1
Проверка, что все символы в
с позиции и до и с начала и до конца совпадают:boolean restEquals(char[] y, int fromIndex, char[] x, int toIndex): for (i = fromIndex .. toIndex) if (y[i] != x[i - fromIndex]) return false return true
Стадия препроцессинга (совпадает со стадией препроцессинга в алгоритме Бойера-Мура):
int[] preBmBc(char[] x, int m): int[] result = int[ASIZE] //Где ASIZE — размер алфавита for (i = 0 .. ASIZE - 1) result[i] = m; for (i = 0 .. m - 2) result[x[i]] = m - i - 1; return result
Основная стадия алгоритма:
void RAITA(char[] x, int m, char[] y, int n): int[] bmBc char c, firstCh, middleCh, lastCh; if (m == 0) return else if (m == 1) //Проверка на случай поиска вхождения одного символа int match = 0 while (match < n) match = findFirst(y, match, n - 1, x[0]) if (match != -1) print(match) else print("No matches") return //Вычисление массива плохих сиволов и объявление первого, последнего и среднего сиволов bmBc = preBmBc (x, m) firstCh = x[0]; middleCh = x[m/2]; lastCh = x[m - 1]; //Поиск int j = 0 while (j <= n - m) c = y[j + m - 1] if (lastCh == c && middleCh == y[j + m / 2] && firstCh == y[j] && //Совпадение шаблона и окна из текста restEquals(y, j + 1, x, j + m - 2)) print(j) return j += bmBc[c]; print("No matches")
Асимптотика
- Фаза препроцессинга требует времени и памяти, где — размер алфавита.
- В худшем случае поиск требует сравнений.
Пример: текст, состоящий только из букв
и образец . В таком случае будет равен , то есть после каждой фазы сравнений мы будем сдвигаться на . Значит, всего будет фаз сравнений, а каждая фаза отработает за , поскольку расхождение будет только в третьем с конца символе, то мы сравним сначала последний, потом первый, потом средний, а затем пойдем с самого начала, сравнивая все символы подряд. Итого получаем асимптотику- В лучшем случае требует сравнений.
Пример: текст вида
и образец . В таком случае будет равен . Значит, всего будет не более чем фаз сравнений, а каждая фаза (кроме той, в которой мы нашли вхождение строки) будет работать за , поскольку расхождение будет уже в последних символах. Итого получаем асимптотикуСравнение с Алгоритмом Бойера-Мура
В своей статье Тим Райта экспериментально проверил ускорение алгоритма на реальных текстах. Тесты были приведены в техническом отчете, написанном на английском языке. Длина текста составила
символов. Использовался ASCII алфавит (подразумевается теоритический размер алфавита, равный , в тексте было использовано только символов.) Шаблоны длиной символов случайно выбирались из текста, а затем проходил их поиск в тексте. (См. рисунок)Результат показывает ускорение модификации алгоритма на
относительно оригинального на всех шаблонах. Шаблон встречался в тексте как минимум один раз (из-за метода его выбора). Однако, результаты теста на шаблонах, которые не встречались в тексте, были очень похожи на верхнюю кривую. Очевидно, что шаблоны, имеющие часто встречающиеся суффиксы, такие как или вносят наибольший вклад в быстродействие модификации. (В алгоритме Бойера-Мура мы будем идти с конца, пока не найдем различия, то есть произведем сравнение на всем суффиксе, в то время как в алгоритме Райта мы выйдем сразу после несовпадения первых символов).Кроме того, производительность растет с увеличением
, поскольку вклад сравнений первого, последнего и среднего символа уменьшается. С другой стороны, производительность ухудшается с уменьшением размера алфавита, поскольку вероятность того, что первый, средний и последний символ из шаблона и текста совпадут, увеличивается. Однако Тим Райта в своей статье пишет, что несмотря на теоритическую возможность ухудшения, на практике, скорее всего, разница будет заметна лишь на очень маленьких алфавитах (например, длины ).Пример
Пусть нам дана строка
и образецПостроим массив
:Рассмотрим шаги алгоритма:
В итоге, чтобы найти одно вхождение образца длиной
в образце длиной , нам понадобилось сравнений символов.